为保证正常的教学秩序，制定了《仪器设备管理岗位制》，《仪器设备损坏、丢失事故处理办法》，《大型仪器设备操作规则》等规章制度。对仪器设备的管理是校设备处主管，实验室验收入账，对所有的设备进行实质性的管理和负责，并引入负责人制度，即每一台设备都指定专门负责人。对教学以外的设备使用实行申请制度，在不影响正常教学的情况下由系部领导和中心各实验室分管人签字才能使用，大型仪器需经学院批准方可教学以外使用。实验设备维护和运行的良好制度保证了教学资源合理高效利用和实验教学、学科建设正常进行。

近年来，每年投入专项维修经费，用于实验中心的仪器设备维护维修，实验耗材的补充，仪器设备的定期标检等。